皮卡丘特点:静电
技能:电击，100千伏，打雷，闪电，铁尾巴，高速移动，伏攻击
肖智最初的伙伴，个性顽强，不愿进入神奇宝贝球或进化。起初，他与肖志并不友好，在与凶猛的麻雀的战斗中，与肖志建立了坚不可摧的友谊。皮卡丘离开小智的时候，照顾其他的神奇宝贝。除了小智一行的神奇宝贝，最好的朋友是一对投手。最早出现在EP001。
◆姆克儿(DP编号002) →慕克鸟(DP编号013) →慕克鹰(DP编号118)。
特点:眼神犀利→恐吓→恐吓
技能:闪电闪现，啄击，转身攻击，狂暴风暴，翼击，英雄鸟，近身攻击
最早出现在DP002，在寻找皮卡丘的时候，长尾怪手不小心弄伤了一只姆克儿，于是愤怒的胖子攻击了长尾猴子。被肖志制服后，它也加入了寻找皮卡丘的行列。DP013中，胖翁在森林里保护着会飞的神奇宝贝，进化成了大胖翁。DP0118年，小智和大胖翁参加了神奇宝贝擂台赛，在与真嗣的对决中进化成了Mukeyhawk。
◆草苗龟(DP编号005) →森林龟(DP编号100)
特点:郁郁葱葱
技能:撕咬，光合成，冲击，飞刃，能量球，攀岩。
第一次出现在DP005，皮卡丘一开始就被火箭带走了，小智在追赶的路上不小心出了意外。另一方面，一只小海龟救了皮卡丘。另一方面，小智被叶雪所救，并从她口中得知了草苗龟，认为这个草苗龟可爱而强大。皮卡丘回来后，肖智在叶雪的建议下制服了草苗龟。在DP100中，真嗣的乌鸦头相遇时进化，却因为无法使用之前的战斗方式而苦恼。那天晚上，真嗣的土台龟教了一种新的战斗方法。
◆小火焰猴(DP号051) →猛火猴(DP号字)
特点:火力猛
技能:火花，火焰车，喷火焰，挖洞，抓挠。
原本是真嗣的神奇宝贝。DP050年，小智和真二建立伙伴关系，分别用皮卡丘和小火猴参加两人合作会议。DP051，小智和真嗣晋级四强。但是小火猴的战斗状态却无法很好的调整。面对这种情况，保罗非常失望，放走了小火猴！目睹一切的小智见此情景，说了一句“我们一起去旅行，变强吧”，安抚了小火猴。DP052决赛，小智带着小火猴参赛并获胜，获得了舒适的铃铛。
◆泳气鼬(DP第054号)
功能:灯光
技能:音爆，水射流，水枪，水波动
公元034年，肖志一行人在河边钓鱼，遇到泳气鼬，二人大打出手，抢夺鱼竿，被小光制服。在DP055中，用一只因为喜欢精灵战斗而喜欢华丽较量的长尾猴子换来的，送给了小智。
◆天蝎座(DP 063号)→天蝎王(DP 084号)
功能:怪力剪刀，沙子隐形。
技能:飞沙脚，钢翼，剪刀十字拳，噪音，连续切割，火焰牙
DP064年因为喜欢小智所以和小智一起旅行，超级贪心。我因为贪念多次掉队，但每次都没能飞好，肯定落在小智身上，但有时候它的落后还是挺有用的。招式最早是在DP70年知道的，在DP85年因为被火箭军团俘虏而进化，然后肖智因为小茂提供的尖牙和天蝎一起逃走了。
神奇宝贝留下了
◆妙蛙种子(编号010)
特点:郁郁葱葱
技能:冲击，寄生种子，藤鞭，飞刃尖刀，催眠粉，阳光火焰。
EP010中肖智的神奇宝贝是继皮卡丘之后肖智手中最长的神奇宝贝。在《奇迹花园》中，妙蛙种子拒绝进化论。在第226集，妙蛙种子回到了镇心镇，并成为了守护他周围的神奇宝贝的守护者。妙蛙种子获得了草地神奇宝贝锦标赛的亚军。后来还参加了城城联盟和对开发区的比赛。顺带一提，妙娃种子是丰原地区唯一出现过的神奇宝贝。
◆大钳蟹(013号)→大螯蟹(076号)
特征:未知
技能:瞪眼，冒泡，砍，踩，灭死光，蟹拳，硬拳，水枪。
小智在EP013中被安抚的第七只神奇宝贝，一被安抚就被送回了达木博士研究所，体积比小茂的大钳蟹小很多。在EP076中，推翻了武功的椰蛋树进化成了一只巨大的螯蟹。看起来和达木博士的关系甚至比小智还要好，也许是因为小智用的比较少，只用了三次。
臭臭泥(第030名)
特征:未知
技能:泰山压顶，臭泥炸弹，掌掴。
在公元030年之前，他是摧毁发电厂的臭泥领导人。肖智安抚了它之后，他经常和达木博士等人呆在一起。喜欢牵制其他人和神奇宝贝。
◆陶洛斯× 30(第035号)
特征:未知
技能:角撞，暴力碰撞，地震，地裂，暗影分身。
EP035野元野区的神奇宝贝喜欢跑得快。参加了橙衣联赛，城市联赛和对开发区的比赛。
◆卡比兽(第095位)
特征:未知
技能:沉睡，铁头功，速冻拳，百万吨拳，灭死光，冲击，应对泰山。
EP095里小智的“胃王”很特别。他是一个卡比兽人，知道如何游泳(和蝶泳)，比他的同龄人更快。橙色联盟决赛前，卡比兽睡不着觉。结果，肖志把它换成了肯泰罗，留在了达木研究所。后来参加了首都圈的神奇宝贝相扑大会并获奖。结果，它一次吃光了一年的奖品食物。随后，卡比兽还参加了城城联盟道馆竞赛、白银大会和挑战发展竞赛。
◆赫拉克洛斯(编号120)
特征:未知
技能:撞角，狂攻，忍耐，冲击，砰击，兆音，闪烁。
小智的神奇宝贝，EP120录取，喜欢吸树枝和喵娃种子的汁液，多次参加道教和联盟比赛。后来在EP147，肖志因为要去参加肯泰罗的陪练大赛，被送回了达木博士研究所。后来还参加了对开发区的比赛。
◆菊花叶(127号)→月桂叶(200号)
特点:郁郁葱葱
技能:飞刃尖刀，藤鞭，泰山压顶，甜蜜，冲击。
在EP127中，被小智录取的神奇宝贝喜欢小智，嫉妒皮卡丘可以一直活在魔表神奇宝贝球之外。在EP200逃离火箭后，演变成月桂叶。肖志去丰原时把它留在了达木研究所。
◆火球鼠(编号142)
特点:火力猛
技能:冲击，闪电，烟幕，高速星辰，高速移动，喷射火焰。
在EP142与一名训练师比赛后，被肖志制服。一开始火球鼠没有很好的锻炼火焰技能。肖志去丰原时把它留在了达木研究所。
◆小锯鳄(编号152)
特点:激流
技能:水枪，鬼脸，撕咬，火箭锤，铁拳，劈
在EP152中，小智和小霞同时投掷诱饵球制服了一只小锯鳄，小智通过神奇宝贝之战击败了小霞得到了小锯鳄。他很喜欢跳舞，他的舞蹈有助于战斗。肖志去丰原时把它留在了达木研究所。
◆猫头夜鹰(颜色违规)(编号155)
特征:未知
技能:催眠，意念，冲击，啄食，看穿，狂暴风暴。
在EP155中，神奇宝贝的颜色很奇怪，是罕见的智商极高的神奇宝贝。小智很难接受。肖志去丰原时把它留在了达木研究所。
◆小象(出生编号231) →顿甲(AG编号153)
特点:捡拾→稳固
技能:觉醒，翻滚，猛击，秘能，灭死光，地震，防御量。
在EP229赢得神奇宝贝比赛后，小智得到了小象的彩蛋，它非常喜欢玩。去丰原的时候，小智把它留在了达木博士的研究所。在去开发区的旅途中，大象回到了肖志的团队。在AG154中，为了从火箭手中拯救皮卡丘，它进化成了顿甲，成为击败战斗设施的重要力量。当去新奥区时，肖志又一次把它留在了达木研究所。
◆傲骨燕(AG编号004) →大王燕(AG编号080)
特点:坚持不懈
技能:啄击，转身攻击，翼击，闪电闪现，暗影双人。
AG004原本是狮群的首领，偷吃了肖志一行的食物后与肖志展开了战斗，最终被肖志制服。在AG080的魔戒比赛中演变成大王燕并获奖。肖志去新奥区时，把它留在了达木研究所。
◆木首公(AG号007) →森林蜥蜴(AG号066) →蜥蜴王(AG号161)
特点:郁郁葱葱
技能:掌掴，闪电闪现，种子机枪，敲门，刀刃，太阳火焰。
原来，它是生活在巨树上的一群木须弓中的一只。AG007年，小智和它一起保护和对抗巨树，后来制服了它。它有点叛逆，嘴里总是叼着一根树枝。它在AG066和嚎叫炸弹的战斗中进化成了森林蜥蜴。进化后，它喜欢一个人静静地坐在一个地方。在AG161中，他在保护自己最爱的菊花时进化成了一只蜥蜴王，随后失去了所有技能。修复后的蜥蜴王变得非常强大，肖智去新奥区时把它留在了达木研究所。
◆萧冰龙虾(AG编号023)
特征:未知
技能:蟹拳，泡沫光，泡泡，硬，挖洞，切割。
AG023年在海边以捣乱者的身份出现，在小智被发现并战斗后将其征服。龙虾蝙蝠侠很有个性，有点吃醋。肖智在他去新奥区时把他留在了达木研究所。
◆煤龟(AG编号058)
特征:白雾
技能:喷火，铁壁，重击，泰山压顶，燃尽，热风。
AG058年，煤龟受到一群钢铁神奇宝贝的攻击，小智引导它打败了钢铁神奇宝贝。煤龟无论开心还是难过，总是喜欢哭。在AG132，小智把它留在了达木博士的研究所。
◆雪童子(AG号108) →冰鬼保护(AG号122)
特征:未知
技能:冰风，冰光，暗影神通，铁头技能，粉雪。
AG108年，伊萨贝岛上的一个雪童偷走了小智的徽章盒，小智在暴风雪中尽力保护雪童，后来加入了小智的队伍。小智一直训练它冻光。AG122经过一次成功的训练，进化成了冰鬼护体。在AG132中，肖智把它留在了达木博士的研究所里。
◆小火龙(编号011) →火恐龙(编号043) →喷火龙(编号046)在编号134受训。
特点:火力猛
技能:喷火，燃尽，地狱翻滚，摔在地上，龙之怒，旋风，愤怒，火花，猛击，冲击，飞行，吸龙，火箭锤，火焰漩涡，钢翼。
小火龙是一只被另一个训练者抛弃的神奇宝贝。在EP16中，小智在雨中救出了小火龙，最终加入了小智的队伍。在EP042击败椰蛋树军团后，他进化成了一只火恐龙。进化之后，火恐龙开始有点不听话了。在EP045中，为了从化石神奇宝贝手中救出小智，火恐龙进化成喷火龙与化石翼龙战斗。然后喷火龙就不听小智的话了，这让小智在神奇宝贝联盟应时大会八分之一决赛中输给了里奇。EP011被冻在橙岛，小智的细心呵护终于感动了喷火龙。喷火龙也成为了小智的主力。在EP135中，为了让喷火龙更好的修炼，小智把它留在了喷火龙之谷。在EP254中，喷火龙出现并在烟莫道阁快节奏暴龙横冲直撞、大都会联盟白银大会、对抗工厂、对抗金字塔的比赛中发挥了重要作用。在水晶塔的皇帝中，他甚至和炎帝(未知图腾创造的环境不是真正的炎帝)竞争过。
◆杰尼龟(编号012)安置在编号148。
特点:激流
技能:冲击，水枪，泡沫光，高速旋转，缩壳，火箭头锤，水炮。
原来是在枯叶城附近制造事端的杰尼龟军团首领，在EP012中被肖智制服。它所领导的杰尼龟消防队曾经制造了许多麻烦，后来从亮亮变成了杰尼龟消防队。在EP148的神奇宝贝消防比赛中，我遇到了杰尼龟消防队，然后归队了。之后回来参加城城联盟和对开发区的比赛。
我曾经拥有的神奇宝贝。
◆热猴(025号)029号转让
特征:未知
技能:百万吨飞腿，手刀，摔在地上，狂抓，抓挠，横冲直撞。
EP025，小智第一次见到它是一只猴子怪物。为了追回帽子，小智用了各种方法，但都失败了。后来火箭的小次郎用脚把猴怪踢得远远的，然后猴怪突然演变成了热猴。为了追回帽子，小智与之搏斗并将其制服。热猴一开始并没有听从小智的命令。在EP029的P1杯格斗大赛中，肖智对热猴的拯救终于打动了他。后来小智决定让它留下来训练，成为P1的真正冠军。
◆比比鸟(003号)→比比雕(082号)082号野生。
特征:未知
技能:冲击，啄击，狂暴风暴，飞沙脚，翼击，旋风，闪电，献祭攻击
EP003年，小智收到了第二个神奇宝贝。比比鸟在关东地区的行程中，参加了一系列的道场和联赛比赛。EP082年，为了保护长盘森林里的波波鸟和比比鸟，进化成了雕塑，打败了凶猛的雀类和大嘴雀，留下了小智。
◆绿色毛毛虫(003号)→meta pod(003号)→八大虎(004号)→065438号+05交换* 2 0265438号+0野生。
特点:磷粉→脱皮→复眼
技能:冲击，旋转，硬，眠粉，麻痹粉，毒粉，旋风。
EP003中，小智是第一个接手的神奇宝贝。它喜欢小霞，但小霞讨厌蠕虫。在阻止火箭攻击的过程中，它进化成了Metapod。它在EP004击败大针锋后迅速演变成蝴蝶。它在EP015中与一个训练师的LADA交换过，但后来被交换回来了。在EP021中，她遇到了一只粉红色的雌蝶，离开了小智。
◆LADA(015号)当季交易所
技能:愤怒的门牙
EP015年，肖智参加了在圣阿奴号上举行的大会，用一个训练师的拉达交换了巴塔哥尼亚，后来肖智又换回了巴塔哥尼亚。
◆鬼斯通(023号)转024号
技巧:舔舌头
EP023年，小智为了再次挑战金道观，来到了资源镇的神奇宝贝塔。和小智玩了一段时间后，同意和纳吉的永吉拉对战。但是当EP024回到金路馆的时候，鬼斯通已经不见了。小智只好拿出皮卡丘来打。在战斗中，鬼斯通来戏弄永吉拉和纳兹，逗他们笑，所以小智赢了这场比赛。最终，小智决定把它留在黄金道场和纳粹党一起生活。
◆乘龙(085号)在114号野。
技能:水枪，冰灯，冲浪，应付泰山。
在EP085中，小智为了拯救它，让它与家人团聚，将其制服。乘龙帮助肖智一行穿梭于奥兰群岛之间，并参加了道馆比赛和奥兰联盟优胜者杯。在EP114，小智把它送回了家里。在城市联盟之旅中，肖志再次遇到了乘龙，现在已经成为了乘龙集团的队长。
◆小火马→烈马
原来是一只神奇宝贝参加了保护区的赛会，但它的主人却因为有人对它的暗算而受伤。为了报仇，小智借小火比试，途中再次被暗算。凭借其特殊的耐力，最终演变成一匹烈马，为小智夺冠。
◆大针蜂(EP号162)作为棋子转让。
小智在神奇宝贝捕虫大会上抓的。因为奈奈喜欢黑黄相间的神奇宝贝，所以他把大针蜂送给了奈奈。
◆金鱼王
EP169肖志参与金鱼王渔战中的临时占有。
◆ Yu Kira(生于第259句)在第265句被释放。
原来，神奇宝贝蛋被偷猎者偷走了。小智在EP259得到了这个神奇宝贝彩蛋。它在基拉孵化后，非常害怕人类。公元265年，受空木博士的委托，肖智把它带回了白银山，最终消除了它对人类的恐惧。
◆长尾怪手(AG no . 181)DP no . 055 exchange。
技能:高速星，影在两处，集中猛击，双攻。
在AG178偷了小智的帽子和梅的丝带纪念奖牌盒，后来还上演了多次恶作剧。在AG181被小智征服。在AG191中，它决定跟随小智前往圣地。在DP055中，因为我喜欢华丽的比赛，我和喜欢神奇宝贝战斗的小光叉尾浮鼬交换了位置。
◆李欧陆
特种兵李欧鲁能够使用“波导弹”。小智一行和神奇宝贝保育人士护送他逃离偷猎者，最后研究人员将他带走。
见DP71.72。
◆雷丘
小治在神奇宝贝暑期研习班中画的神奇宝贝将陪伴小治完成整个课程。起初，雷丘胆怯而不自信。但是在小智的鼓励下，他变得自信了。参见DP88。
◆跳跳猪
小智在神奇宝贝暑期研习会上画的神奇宝贝，正在帮助小智通过铁人三项。参见DP91。
◆荧光鱼
小智在神奇宝贝夏季研讨会上画的神奇宝贝，正在帮助小智在铁人三项赛中游泳。参见DP91。
◆沙瓦朗
暂时的
◆3D龙
小智在虚拟世界里用一条3D龙追火箭。
◆阿柏怪
小智在参加神奇宝贝鉴定考试的时候临时拿到了神奇宝贝，帮助小智战斗。参见EP55。
◆双弹毒气
小智在参加神奇宝贝鉴定考试的时候临时拿到了神奇宝贝，帮助小智战斗。参见EP55。
◆喵喵喵
◆咕咕
小智来到迷茫的森林，咕咕的带路离开。参见EP122。