日本的侦探类动漫有很多，以下是一些比较知名的作品：
《名侦探柯南》：原作自1994年问世以来，至今依然经久不衰，堪称日本动漫界的一大奇迹。男主角工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩。新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器，从此就以江户川柯南的身份侦破了一个个案件。
《金田一少年事件簿》：也是一部非常受欢迎的侦探动漫。故事主要围绕高中生金田一和其同学展开，通过讲述他们破解各种案件的过程，展现了主人公的推理才华和敏锐的观察力。
《约定的梦幻岛》：这是一部特别受欢迎的高智商烧脑动漫，故事设定在一所孤儿院。一群无忧无虑生活在孤儿院的孩子们，有一天发现了一个惊人的事实，围绕在他们身边的幸福景象其实是险恶重重的地狱，而成长到十二岁就可以被领养的传闻，实际上是被当成养殖的肉猪贩卖，所谓被嘱咐不要翻过的围墙，是因为外面就是刽子手的厨房。
此外，《魔角侦探》、《反叛的鲁路修》、《命运石之门》等也是不错的侦探类动漫作品。